-
安装Docker和相关工具:
- 安装Docker:从Docker官网下载安装命令,如
docker-compose install启动容器构建工具。 - 安装必要的依赖包:R可以通过
R CMD INSTALL安装,Python可以通过pip3 install安装。
- 安装Docker:从Docker官网下载安装命令,如
-
启动Python或R环境:
- 使用Docker CLI启动环境:
docker-compose up python:3 docker-compose up r:3
- 使用Docker CLI启动环境:
-
配置项目:
- 设置项目路径:在项目目录下创建
upstream/和project/子目录。 - 安装项目依赖:使用
R CMD INSTALL或pip3 install安装必要的R包。
- 设置项目路径:在项目目录下创建
-
安装测试工具:
- 安装
pytest:pip3 install pytest - 安装R的编译工具:
R CMD INSTALL --no-gui
- 安装
-
使用Docker Compose工具:
- 基于Docker Compose构建的工具,如
docker-compose build和docker-compose up --with-externals,可以进行本地编译和镜像构建。
- 基于Docker Compose构建的工具,如
-
学习文档和教程:
查阅Docker Compose的文档和教程,学习如何编写命令行脚本和使用更多工具。
通过这些步骤,你可以利用Docker在科学环境和项目中运行Python和R,同时利用Docker Compose的扩展功能进一步开发和构建科学应用。
